Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SQLEQ14534 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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