Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GTF2H3Q13889 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms