Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNTB1Q13884 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms