Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TUBA3CQ13748 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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