Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSTA3Q13630 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 394.5 ms