Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4BQ13620 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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