Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NAE1Q13564 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
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