Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MSLNQ13421 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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