Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTBP1Q13363 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms