Protein–RNA interactions for Protein: Q13349

ITGAD, Integrin alpha-D, humanhuman

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGADQ13349 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGADQ13349 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms