Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DUSP4Q13115 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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