Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
CHAF1BQ13112 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CHAF1BQ13112 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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