Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
IFT88Q13099 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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IFT88Q13099 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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IFT88Q13099 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IFT88Q13099 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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