Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRDNQ13061 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
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