Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NPRL3Q12980 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms