Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
COX10Q12887 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COX10Q12887 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COX10Q12887 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms