Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BPTFQ12830 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms