Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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RAB40BQ12829 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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RAB40BQ12829 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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RAB40BQ12829 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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RAB40BQ12829 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB40BQ12829 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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