Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LMOD3Q0VAK6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms