Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
FAM27E3Q08E93 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms