Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SRSF4Q08170 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms