Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAD51Q06609 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms