Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GABPB1Q06547 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms