Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
APLP2Q06481 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms