Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PSME1Q06323 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms