Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DEUP1Q05D60 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms