Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSPL2Q05D32 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms