Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms