Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFHR1Q03591 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms