Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CAV1Q03135 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms