Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GCNT1Q02742 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GCNT1Q02742 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms