Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSC2Q02487 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms