Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms