Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SLC6A3Q01959 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SLC6A3Q01959 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms