Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPCQ01831 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPCQ01831 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
XPCQ01831 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPCQ01831 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms