Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EXOSC10Q01780 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC10Q01780 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms