Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MS4A2Q01362 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MS4A2Q01362 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms