Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
E2F1Q01094 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms