Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX6P78412 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX6P78412 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX6P78412 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX6P78412 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX6P78412 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX6P78412 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX6P78412 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX6P78412 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms