Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ERVFRD-1P60508 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms