Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RIPK4P57078 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms