Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GFRA1P56159 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms