Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SNU13P55769 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNU13P55769 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNU13P55769 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNU13P55769 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNU13P55769 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNU13P55769 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNU13P55769 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNU13P55769 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNU13P55769 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNU13P55769 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNU13P55769 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNU13P55769 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SNU13P55769 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNU13P55769 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNU13P55769 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SNU13P55769 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNU13P55769 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNU13P55769 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNU13P55769 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNU13P55769 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms