Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CASP9P55211 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP9P55211 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP9P55211 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP9P55211 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP9P55211 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP9P55211 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP9P55211 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP9P55211 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP9P55211 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP9P55211 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CASP9P55211 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASP9P55211 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASP9P55211 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms