Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RAD23AP54725 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms