Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNB3P54284 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNB3P54284 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNB3P54284 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CACNB3P54284 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNB3P54284 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CACNB3P54284 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CACNB3P54284 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CACNB3P54284 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CACNB3P54284 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CACNB3P54284 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms