Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PGGT1BP53609 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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PGGT1BP53609 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PGGT1BP53609 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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