Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LHX2P50458 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX2P50458 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX2P50458 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX2P50458 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX2P50458 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX2P50458 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX2P50458 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LHX2P50458 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX2P50458 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX2P50458 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX2P50458 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX2P50458 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX2P50458 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX2P50458 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX2P50458 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX2P50458 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LHX2P50458 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms