Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GSK3AP49840 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GSK3AP49840 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms