Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CLK1P49759 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CLK1P49759 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CLK1P49759 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CLK1P49759 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms